超声波是破坏细胞结构的一种有效手段。该效应可用于提取细胞内的物质。例如，从细胞基质中提取淀粉。
超声波在暴露的液体中产生交替的高压和低压。在低压循环期内，超声波在液体中产生真空小气泡，在高压循环过程中真空小泡剧烈的破裂，这种显现被称为空化。空化气泡的内爆引起强烈的流体动力剪切力。
剪切力可以将纤维，纤维状的材料分解成细胞颗粒并破坏细胞壁的结构。这将细胞内的物质，如淀粉和糖释放到液体中。除此之外，细胞壁材料被破碎成小碎片。
该效果可以用于有机物的发酵、消化和其他转换过程。在微磨和研磨之后，超声波使更多细胞内的物质进行转换，例如淀粉以及细胞壁碎片分别转换为糖和酶。它还增加了在液化或糖化过程中接触酶的表面积。这通常会增加酵母发酵和其他转换过程的速度和产量，例如提高生物质的乙醇产生。
